企业申请质量管理体系认证的流程一般如下：
前期准备：
建立质量管理体系：企业需依据 ISO 9001 标准要求，建立文件化的质量管理体系，并运行三个月以上。体系应涵盖质量方针、目标，以及产品实现、资源管理、测量分析与改进等过程。
进行内部审核与管理评审：至少开展过一次内部质量管理体系内审与管理评审。内审需覆盖所有场所和标准条款，以确保体系的有效性和符合性，管理评审则由最高管理者对体系的适宜性、充分性和有效性进行综合评价。
准备相关材料：包括质量手册、程序文件、企业简介、组织机构图、产品目录、生产工艺流程图（如有）、法律法规清单等。
提交认证申请：
选择认证机构：企业可通过网络搜索、行业推荐或咨询机构建议等方式，选择具有良好信誉和资质的认证机构。
填写申请表：向认证机构提交《质量管理体系认证申请表》及相关附件，如营业执照复印件、资质证明（若有）等。
申请评审：认证机构对申请材料进行评审，审查内容包括填报信息的完整性、正确性，以及质量手册是否覆盖标准要求等。符合要求的，认证机构发出 “接受申请通知书”，并通知后续工作安排及预交认证费用；不符合要求的，要求企业补充或修改材料。
第一阶段审核（文件审核）：
送交体系文件：企业将正式发布的质量管理体系手册、程序文件送交认证机构。
文件审查：审核组长对文件进行审查，重点关注文件的符合性和完整性，以及与标准的契合度。
结果反馈与整改：如有不符合处，认证机构书面告知企业，企业进行修改直至满足要求。
第二阶段审核（现场审核）：
审核计划安排：认证机构确定现场审核时间，组成审核组，并将审核计划提前通知企业。
现场审核实施：审核组依据认证标准，对企业的质量管理体系进行全面审核，包括各部门的运作情况、生产现场的管理、文件执行情况等。审核以抽样方式进行，通过查阅文件记录、与员工交谈、观察现场操作等收集证据。
开具不符合项：审核组对发现的问题开具不符合项报告，明确不符合的事实、依据标准条款以及整改要求。
审核报告编写：现场审核结束后，审核组编写审核报告，包括审核概况、发现的问题、审核结论等，并提交认证机构。
问题整改：
企业制定整改计划：针对不符合项，企业分析原因，制定详细的整改计划，明确责任人和整改期限。
实施整改措施：企业按照整改计划落实整改措施，对相关文件进行修订、对员工进行培训、改进生产过程等。
提交整改证据：完成整改后，企业向认证机构提交整改证据，如修订后的文件、培训记录、改进后的现场照片等。
审批与注册发证：
认证机构审查：认证机构对审核报告、整改证据等进行全面审查。
作出认证决定：经审查，符合认证要求的，认证机构予以注册并颁发注册证书；需改进后才能通过认证的，书面通知企业需纠正的问题及完成期限，到期复查合格后再发证；不符合认证要求的，书面通知企业并说明理由。
获证后监督管理：
监督审核：在证书有效期内，认证机构通常每年进行一次监督审核，以确保企业质量管理体系持续有效运行。监督审核流程与初次审核类似，但重点关注企业对上次审核不符合项的整改情况、体系的变更以及持续改进情况等。
证书维护：企业需按时缴纳监督审核费用，配合认证机构的监督审核工作，保持体系的有效运行，以维持证书的有效性。
复评认证：证书有效期届满前，企业应提前申请复评认证，复评流程与初次认证基本一致。通过复评后，认证机构换发新证书。
